재고자산 평가방법 선택 가이드 — 선입선출·총평균·이동평균 비교와 세무 신고 실무

2026년 6월 9일읽는 데 3분

요약

재고자산 평가방법에 따라 매출원가와 법인세가 달라져요. 최초 평가방법은 기한 안에 신고하고, 바꿀 때는 절차와 기한을 지켜야 해요.

재고자산 평가방법이 왜 중요한가요?

재고자산 평가방법은 기말 재고 자산의 장부가와 당기 매출원가를 결정해요. 평가방법에 따라 매출총이익이 달라지고, 결국 법인세·소득세 부담도 달라져요. 한 번 선택하면 일관되게 적용해야 하며 변경 시 세무서에 신고해야 합니다(법인세법 시행령 제75조).

주요 평가방법 비교

방법	원가 흐름 가정	물가 상승 시 매출원가	물가 상승 시 기말재고	물가 상승 시 이익
선입선출법(FIFO)	먼저 취득한 것을 먼저 판매	낮음 (구매 단가 적용)	높음 (최근 단가 적용)	높음 → 세금 ↑
총평균법	기간 내 평균 단가로 전량 계산	중간	중간	중간
이동평균법	취득할 때마다 평균 단가 재계산	중간 (총평균보다 빠른 반영)	중간	중간
개별법	각 물품의 실제 취득원가 추적	실제와 동일	실제와 동일	실제와 동일

물가가 지속적으로 상승하는 환경에서는 총평균법·이동평균법이 선입선출법보다 당기 이익과 세금 부담을 낮추는 효과가 있습니다. 단, 2007년부터 한국 회계기준에서는 후입선출법(LIFO)이 폐지됐으므로 사용 불가해요.

최초 평가방법 신고 기한과 절차

법인은 설립일이 속하는 사업연도의 법인세 과세표준 신고기한까지 관할 세무서에 재고자산 평가방법을 신고해야 합니다(법인세법 시행령 제74조 제3항). 이미 신고한 방법을 바꾸려면 변경하려는 사업연도 종료일 전 3개월이 되는 날까지 변경 신고해요.

신고 방법: 홈택스 [신청/제출 → 재고자산 등 평가방법 신고]
무신고 시 적용: 기한 내 신고하지 않으면 선입선출법이 강제 적용됩니다(법인세법 시행령 제75조 제4항). 물가 상승기에는 선입선출법이 이익과 세금 부담을 높이므로 불리할 수 있습니다.

평가방법 변경 — 절차와 주의사항

이미 신고한 평가방법을 바꾸려면 변경하려는 사업연도 개시일로부터 3개월 이내에 변경 신고를 해야 해요.

구분	기한	무신고·지연신고 시
최초 신고	사업연도 개시일로부터 3개월 이내	선입선출법 강제 적용
변경 신고	변경 적용 사업연도 개시일로부터 3개월 이내	직전 평가방법 계속 적용 (변경 인정 안 됨)

주의: 평가방법을 자주 바꾸면 세무서의 의심을 살 수 있습니다. 변경 사유가 합리적이어야 하며, 특히 이익이 많이 발생한 연도에만 세금 절감 목적으로 변경하면 부당행위계산 부인 검토 대상이 될 수 있습니다.

품목·사업장별 다른 방법 적용 가능한가요?

네. 동일한 사업자라도 재고자산의 종류별·사업장별로 각각 다른 평가방법을 적용할 수 있습니다(법인세법 시행령 제75조 제1항). 예를 들어 원재료는 총평균법, 제품은 선입선출법을 따로 선택할 수 있습니다. 단, 선택한 방법은 해당 품목·사업장에 일관되게 적용해야 해요.

자주 하는 실수

신규 법인 최초 신고 누락: 법인 설립 후 바빠서 재고자산 평가방법 신고를 하지 않으면 선입선출법이 자동 적용돼요. 설립 후 3개월 이내에 반드시 신고하십시오.
ERP 평가방법과 세무 신고 불일치: ERP에서는 이동평균법을 사용하지만 세무서에는 총평균법으로 신고해둔 경우가 있습니다. 연말 결산 전 ERP 설정과 세무 신고 내용의 일치 여부를 확인하십시오.
저가법 적용 시 평가방법과 혼동: 재고자산을 시가와 원가 중 낮은 것으로 평가하는 저가법(K-GAAP 적용 가능)은 별도 사안입니다. 취득원가 결정 방식(선입선출·총평균 등)과 저가법은 별개입니다.

재고자산 평가방법 체크리스트

신규 법인: 설립 후 3개월 이내 재고자산 평가방법 신고 완료
기존 법인: 현재 신고된 평가방법 확인 (홈택스 신청이력 조회)
ERP·회계 프로그램의 재고 평가방법과 세무 신고 내용 일치 여부 확인
평가방법 변경 계획 시 변경 사업연도 개시일로부터 3개월 이내 신고 일정 등록
품목·사업장별 평가방법 선택 내용 내부 문서로 기록 보관

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